Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM259Q4ZIN3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms