Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TBRG1Q3YBR2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms