Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL24A1Q17RW2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms