Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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GEN1Q17RS7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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GEN1Q17RS7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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GEN1Q17RS7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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GEN1Q17RS7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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GEN1Q17RS7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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GEN1Q17RS7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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GEN1Q17RS7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GEN1Q17RS7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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