Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PFKFB3Q16875 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms