Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR2Q16832 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR2Q16832 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms