Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLPPQ16740 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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