Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NFE2Q16621 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms