Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F4Q16254 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms