Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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