Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA2Q15822 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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