Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITSN1Q15811 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms