Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNHIT3Q15649 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms