Protein–RNA interactions for Protein: Q15582

TGFBI, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBIQ15582 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGFBIQ15582 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBIQ15582 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms