Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF13Q15543 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms