Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms