Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCOLCEQ15113 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCOLCEQ15113 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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