Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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RAB39AQ14964 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB39AQ14964 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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RAB39AQ14964 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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RAB39AQ14964 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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RAB39AQ14964 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB39AQ14964 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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