Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD4Q14839 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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