Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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COL4A6Q14031 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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COL4A6Q14031 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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COL4A6Q14031 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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COL4A6Q14031 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL4A6Q14031 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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