Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms