Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms