Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTAN1Q13813 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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