Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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SHROOM2Q13796 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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SHROOM2Q13796 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
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