Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1orf61Q13536 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms