Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms