Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD4Q13485 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD4Q13485 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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