Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
UBE2V1Q13404 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms