Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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SEMA3FQ13275 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SEMA3FQ13275 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SEMA3FQ13275 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SEMA3FQ13275 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SEMA3FQ13275 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3FQ13275 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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