Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPA4Q13156 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms