Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHAF1AQ13111 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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