Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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