Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC173Q0VFZ6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms