Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPAL4Q0D2K0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms