Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP1Q09161 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCBP1Q09161 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms