Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PUDPQ08623 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms