Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms