Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOS1Q07889 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOS1Q07889 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOS1Q07889 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOS1Q07889 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOS1Q07889 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOS1Q07889 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOS1Q07889 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOS1Q07889 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms