Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PAX8Q06710 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms