Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKCDQ05655 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms