Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms