Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELAQ04206 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELAQ04206 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RELAQ04206 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RELAQ04206 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms