Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A11Q02978 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms