Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP2BQ02880 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP2BQ02880 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms