Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GCNT1Q02742 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms