Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OC90Q02509 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms