Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC6A3Q01959 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms