Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBSQ01459 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms