Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms