Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK6Q00534 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms